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新冠肺炎核酸检测假阴性率为何这么高

新冠肺炎核酸检测假阴性率为何这么高

专家称病毒核酸被降解导致不能正常检出

本报记者 张 晔

新冠肺炎疫情发生以来,关于核酸检测假阴性率过高的话题,不停是各方关注的焦点。有报道称,以荧光定量RT-PCR作为检测手段的新冠病毒检测的阳性率今朝仅有30%—50%,导致奇高的假阴性率。

导致假阴性率发生的缘故原由很多。2月22日,南京大年夜学模式动物钻研所发育生物学与遗传学教授赵庆顺吸收科技日报记者独家采访时指出,依据有关机构宣布的指南,核酸检测前需将采集到的样品进行56℃灭活,这极有可能使新冠病毒核酸被降解,从而导致不能被正常检出,终极前进了假阴性率。该钻研成果《病毒核酸提取前的高温灭活历程显明低落可检出病毒核酸模板量》,已在中国科学院科技论文平台预宣布。

56℃灭活可能导致病毒核酸被降解

2019新型冠状病毒的遗传物质是单链RNA。是以,科研职员的目标是在患者身上找到新冠病毒的RNA。这也是临床诊断金标准。

今朝,临床检测主要采纳荧光定量RT-PCR试剂盒检测。该措施是将标本中的特定RNA序列逆转录落后行扩增,颠末30次以上扩增后,病毒基因片段达到必然数量即可进行可视检测。

“理论上,哪怕模板只有1个病毒,就有可能被检测出来。”赵庆顺说,科研实践中,在模板(病毒)量大年夜于100个的环境下,扩增结果就会异常稳定。

然则,赵庆顺在收集上看到一个教授教化视频,不禁心生疑虑。该视频由北京协和病院和北京市卫健委联合制作。视频3分08秒至3分40秒显示:在制备核酸模板前,需将采集到的样品在56℃前提下进行30分钟病毒灭活。

记者在中华医学会查验医学分会宣布的《2019新型冠状病毒肺炎临床实验室检测的生物安然防护指南(试行初版)》中也看到:核酸扩增前,可以对标本先行消毒。包括56℃孵育30分钟,加蛋白酶K。

中华医学会查验医学分会宣布的《新型冠状病毒肺炎病毒核酸检测专家共识》中,明确指出需将样品56℃孵育至少45分钟或更高温度进行灭活。

记者经由过程采访确认,绝大年夜多半查验医师均按照上述规范,进行56℃前提下光阴不等的病毒灭活,然后才制备核酸模板。

这样做带来的问题是,病毒RNA极易被核糖核酸酶降解,由于这种酶在60℃时活性最高。核糖核酸酶来自两方面,一是样本细胞内,二是采集、保存、运输历程中的外来污染物。

进行灭活处置惩罚是出于生物安然的斟酌

“进行灭活处置惩罚是出于生物安然的斟酌,保护从事检测的事情职员不被病毒感染。”赵庆顺说。

恰是出于这方面的斟酌,国家卫健委宣布的相关文件中,明确要求对标本进行灭活处置惩罚。

北京协和病院制作的教授教化视频以及中华医学会查验医学分会宣布的《防护指南》和《专家共识》,依据恰是来自国家卫健委相关文件,包括《新型冠状病毒实验室生物安然指南(第二版)》《新型冠状病毒肺炎实验室检测技巧指南(第三版)》等。

然则,记者查询了国家卫健委相关文件,其对付病毒灭活的详细措施并未做出明确规定,只是笼统地要求:感染性材料或活病毒在采纳靠得住的措施灭活落后行的核酸检测。

赵庆顺进一步查阅了美国疾控中间、喷鼻港大年夜学公共卫生学院以及华大年夜基因宣布的核酸检测阐明,也未发明56℃灭活这一步骤。

病毒核酸降解对检测结果影响究竟有多大年夜

记者在采访中发明,不合人士对这个问题的回答泾渭分明:

来自疾控部门、中国医学会查验医学分会、相关病院查验医师的见地是,不会对检测结果有太大年夜的影响。而赵庆顺等专家觉得,核酸提取前对人体样品进行高温杀毒处置惩罚,可能是导致新冠病毒核酸检出假阴性率过高的紧张缘故原由之一。

赵庆顺以猪盛行性腹泻病毒(一种冠状病毒,来自活疫苗)为模型开展了高温灭活对病毒可检出量影响的钻研,结果注解:保存在通俗等渗溶液(Hank’s液)中的样品经56℃孵育30分钟,导致样品中可检出的冠状病毒模板削减一半,假如以92℃孵育5分钟,则可检出的冠状病毒模板丧掉96%以上。

“理论上,不扫除新冠病毒的目标RNA片段在56℃以上高温灭活中不易被降解的可能。”赵庆顺坦言,“但我宁愿自己的判断是错的,也不盼望由于某个细节斟酌不周而导致检测结果呈现假阴性。”

别的,不合品牌的样品保存液,也会对检测结果孕育发生较大年夜影响。赵庆顺在实验中发明,在56℃30分钟前提下,采纳南京诺唯赞研发的R503保存液寄放猪盛行性腹泻病毒样品时,病毒核酸的可检出量是对比组(Hank’s液)检出量的3倍;而假如是92℃5分钟灭活,则检出量是对比组的42倍。

中华医学会查验医学分会主任委员王成彬教授在撰文回应核酸检测假阴性率较高征象时也指出,不合提取试剂对着末提取到的核酸数量和质量可能存在区别,从而直接影响检测结果。他建议,对付某些高度疑似病例,或检测结果难以确定的病例,建议用2种以上试剂进行检测、验证。

“假阴性意味着漏检,不仅会导致临床中对疑似患者不能快速确诊,而且会使漏检者成为潜在的病毒熏染源。”赵庆顺为此提出建议,一是只管即便应用无核糖核酸酶污染的样本采集管,二是将标本放置在可保护病毒核酸免受高温灭活毁坏的样品保存液中,从而确保样品RNA从保存、运输到高温灭活等获得全程保护,尽最大年夜可能包管用于临床检测的核酸质量,削减病毒核酸可检出模板在核酸提取前的工资毁坏。

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